Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCHS1Q96JQ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCHS1Q96JQ0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCHS1Q96JQ0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms