Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHDQ96IW2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHDQ96IW2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHDQ96IW2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms