Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEIL1Q96FI4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms