Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDC3Q96F86 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EDC3Q96F86 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EDC3Q96F86 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms