Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC97Q96F63 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC97Q96F63 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms