Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TP53INP1Q96A56 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TP53INP1Q96A56 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TP53INP1Q96A56 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms