Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM54Q969K7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM54Q969K7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM54Q969K7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM54Q969K7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms