Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATA6Q92908 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GATA6Q92908 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms