Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf54Q8WWF1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf54Q8WWF1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.56
C1orf54Q8WWF1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf54Q8WWF1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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