Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDI1Q8WTU0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDI1Q8WTU0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDI1Q8WTU0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms