Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF65

GIPC2, PDZ domain-containing protein GIPC2, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC2Q8TF65 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GIPC2Q8TF65 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIPC2Q8TF65 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GIPC2Q8TF65 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms