Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf43Q8TAL5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf43Q8TAL5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms