Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYRIPQ8NFW9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYRIPQ8NFW9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MYRIPQ8NFW9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms