Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDX1

PSD4, PH and SEC7 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD4Q8NDX1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSD4Q8NDX1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSD4Q8NDX1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSD4Q8NDX1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSD4Q8NDX1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSD4Q8NDX1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSD4Q8NDX1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSD4Q8NDX1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSD4Q8NDX1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSD4Q8NDX1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSD4Q8NDX1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSD4Q8NDX1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSD4Q8NDX1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSD4Q8NDX1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSD4Q8NDX1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSD4Q8NDX1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms