Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF248Q8NDW4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF248Q8NDW4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF248Q8NDW4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms