Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP38Q8NB14 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP38Q8NB14 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP38Q8NB14 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms