Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9G6

Putative UPF0607 protein FLJ37424, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N9G6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8N9G6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8N9G6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8N9G6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8N9G6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8N9G6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8N9G6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8N9G6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8N9G6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8N9G6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8N9G6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8N9G6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8N9G6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8N9G6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8N9G6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8N9G6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8N9G6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8N9G6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8N9G6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8N9G6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8N9G6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8N9G6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8N9G6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8N9G6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8N9G6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8N9G6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8N9G6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8N9G6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8N9G6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8N9G6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8N9G6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8N9G6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8N9G6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8N9G6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8N9G6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8N9G6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8N9G6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8N9G6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8N9G6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8N9G6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8N9G6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8N9G6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8N9G6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8N9G6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8N9G6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8N9G6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8N9G6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8N9G6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8N9G6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8N9G6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8N9G6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8N9G6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8N9G6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8N9G6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8N9G6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8N9G6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8N9G6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8N9G6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q8N9G6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8N9G6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8N9G6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8N9G6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8N9G6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8N9G6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8N9G6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8N9G6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8N9G6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8N9G6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8N9G6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8N9G6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8N9G6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8N9G6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8N9G6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8N9G6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8N9G6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8N9G6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8N9G6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8N9G6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8N9G6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8N9G6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8N9G6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8N9G6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8N9G6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8N9G6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8N9G6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8N9G6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8N9G6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8N9G6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8N9G6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q8N9G6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q8N9G6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q8N9G6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q8N9G6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q8N9G6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8N9G6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8N9G6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8N9G6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8N9G6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8N9G6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8N9G6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms