Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC33Q8N5R6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC33Q8N5R6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms