Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RYBPQ8N488 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RYBPQ8N488 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RYBPQ8N488 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RYBPQ8N488 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms