Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC117Q8IWD4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC117Q8IWD4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC117Q8IWD4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms