Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM50Q86XT4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM50Q86XT4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM50Q86XT4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM50Q86XT4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM50Q86XT4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM50Q86XT4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM50Q86XT4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM50Q86XT4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM50Q86XT4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM50Q86XT4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM50Q86XT4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM50Q86XT4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM50Q86XT4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM50Q86XT4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM50Q86XT4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM50Q86XT4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM50Q86XT4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms