Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD163Q86VB7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD163Q86VB7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD163Q86VB7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD163Q86VB7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD163Q86VB7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD163Q86VB7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD163Q86VB7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CD163Q86VB7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD163Q86VB7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms