Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APTXQ7Z2E3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APTXQ7Z2E3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms