Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CATSPER4Q7RTX7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CATSPER4Q7RTX7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CATSPER4Q7RTX7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CATSPER4Q7RTX7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms