Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP47Q6ZTR5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP47Q6ZTR5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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