Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMIGD1Q6UXZ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIGD1Q6UXZ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms