Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC5Q6UXY8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC5Q6UXY8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC5Q6UXY8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC5Q6UXY8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms