Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VSTM1Q6UX27 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSTM1Q6UX27 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSTM1Q6UX27 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms