Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRSAM1Q6UWE0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRSAM1Q6UWE0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRSAM1Q6UWE0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRSAM1Q6UWE0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms