Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAF7Q6Q0C0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF7Q6Q0C0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF7Q6Q0C0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms