Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDF2Q6PJF5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHBDF2Q6PJF5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDF2Q6PJF5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDF2Q6PJF5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms