Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM88Q6PEY1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM88Q6PEY1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms