Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF544Q6NX49 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF544Q6NX49 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms