Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SLFN13Q68D06 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLFN13Q68D06 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLFN13Q68D06 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFN13Q68D06 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms