Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNX4Q63HM2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PCNX4Q63HM2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCNX4Q63HM2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNX4Q63HM2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms