Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YOD1Q5VVQ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YOD1Q5VVQ6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms