Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYDE2Q5VT97 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYDE2Q5VT97 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYDE2Q5VT97 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYDE2Q5VT97 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms