Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM1

ZNF678, Zinc finger protein 678, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF678Q5SXM1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF678Q5SXM1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF678Q5SXM1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF678Q5SXM1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF678Q5SXM1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF678Q5SXM1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF678Q5SXM1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF678Q5SXM1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms