Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf38Q5JPI3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf38Q5JPI3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf38Q5JPI3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms