Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC4Q5J8M3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC4Q5J8M3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms