Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYL7

TMEM196, Transmembrane protein 196, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM196Q5HYL7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM196Q5HYL7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM196Q5HYL7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM196Q5HYL7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms