Protein–RNA interactions for Protein: Q53EP0

FNDC3B, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3BQ53EP0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNDC3BQ53EP0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC3BQ53EP0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC3BQ53EP0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms