Protein–RNA interactions for Protein: Q495M9

USH1G, Usher syndrome type-1G protein, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1GQ495M9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USH1GQ495M9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USH1GQ495M9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USH1GQ495M9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms