Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBRG1Q3YBR2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TBRG1Q3YBR2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms