Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GNPTABQ3T906 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNPTABQ3T906 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms