Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
TWISTNBQ3B726 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TWISTNBQ3B726 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TWISTNBQ3B726 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TWISTNBQ3B726 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms