Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ8

TMEM249, Transmembrane protein 249, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM249Q2WGJ8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM249Q2WGJ8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM249Q2WGJ8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM249Q2WGJ8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM249Q2WGJ8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM249Q2WGJ8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms