Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC57Q2TAC2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC57Q2TAC2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC57Q2TAC2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC57Q2TAC2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC57Q2TAC2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC57Q2TAC2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC57Q2TAC2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC57Q2TAC2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC57Q2TAC2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC57Q2TAC2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC57Q2TAC2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms