Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGSM1Q2NKQ1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGSM1Q2NKQ1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGSM1Q2NKQ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGSM1Q2NKQ1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGSM1Q2NKQ1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGSM1Q2NKQ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGSM1Q2NKQ1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGSM1Q2NKQ1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGSM1Q2NKQ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGSM1Q2NKQ1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGSM1Q2NKQ1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGSM1Q2NKQ1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGSM1Q2NKQ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGSM1Q2NKQ1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGSM1Q2NKQ1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGSM1Q2NKQ1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGSM1Q2NKQ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGSM1Q2NKQ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SGSM1Q2NKQ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGSM1Q2NKQ1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGSM1Q2NKQ1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGSM1Q2NKQ1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGSM1Q2NKQ1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SGSM1Q2NKQ1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGSM1Q2NKQ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGSM1Q2NKQ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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