Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A12Q1EHB4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC5A12Q1EHB4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A12Q1EHB4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A12Q1EHB4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A12Q1EHB4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A12Q1EHB4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A12Q1EHB4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A12Q1EHB4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A12Q1EHB4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A12Q1EHB4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms